Google DeepMind、次世代DNA予測AI「AlphaGenome 2」を発表

　Google DeepMindは11月11日、細胞レベルでのDNA配列と遺伝子変異の影響を予測する次世代AIモデル「AlphaGenome 2」を発表した。現在、非営利研究向けにAlphaGenome APIを通じて提供され、営利研究向けにはプライベートプレビュー版が用意されている。さらに間もなく、同社のエージェント開発プラットフォームである「Google Antigravity」に「AlphaGenome 2」スキルをリリースする。

　これまでのモデルは、100万塩基のDNA配列から組織全体や細胞株の固定された出力を生成していた。しかし同モデルは、特定の生物学的条件と入力DNA配列を組み合わせる条件付きモデルを採用している。この仕組みにより、同じDNA配列が細胞型によってどのように異なる読み取りをされるかを学習する。

　トレーニングには、68組織にわたる1億個以上の単一細胞プロファイルが使用されている。これにより、変異の影響予測において、原因となる変異を30%対16%、方向性のある遺伝子の影響を43%対23%で特定し、従来の最先端モデルと比較して約2倍の精度で特定する。また、モデルがこれまで扱ったことのない新しい細胞状態のデータに対しても、再学習なしで直接適応する汎用性を持つ。

　さらに、単一細胞生物学とヒト遺伝学を結びつける役割を果たす。ゲノムワイド関連解析（GWAS）で発見された疾患関連変異について、数百種類のヒト細胞における影響を予測し、遠隔制御スイッチと標的遺伝子の関連性マッピングや、原因となる変異体および作用部位となる細胞の特定に貢献する。